Mae bagiau cotwm wedi'u gwneud o ddeunyddiau naturiol 100% yn gwbl fioddiraddadwy yn yr amgylchedd naturiol. Fodd bynnag, nid yw'r lliwiau sy'n seiliedig ar PVC a ddefnyddir ar gyfer argraffu yn-ailgylchadwy; mae llosgi yn rhyddhau deuocsinau, ac mae prosesau ailgylchu yn arwain at wastraff cotwm. Ar ben hynny, mae tyfu cotwm yn ddwys o ddŵr, ac ni ellir compostio'r bagiau'n uniongyrchol.
Rhaid defnyddio bag cotwm organig 20,000 o weithiau i wrthbwyso ei effaith cynhyrchu. Mae bag cotwm safonol yn gofyn am o leiaf 131 o achosion o ailddefnyddio i arwain at lai o niwed amgylcheddol na bag plastig untro. Mae astudiaethau'n dangos bod defnyddio bag cotwm 50-150 gwaith [2-3] neu 327 o weithiau yn arwain at effaith amgylcheddol is na defnyddio bagiau plastig. O ran allyriadau carbon a chynhyrchu gwastraff, mae bagiau plastig yn perfformio'n well na bagiau cotwm. Gall cyfraddau defnydd gwirioneddol fod mor isel â thua 10%.
